Trondheimsfjorden og kysten utenfor binder byen til Fosen, Hitra og Nordmøre – med bilferje til Rørvik og hurtigbåt fra Brattøra.
AtB er oppdragsgiver for både ferjer og hurtigbåter i fylket. Hurtigbåtene fra Brattøra har pris per kaipar i egne tabeller, mens bilferjene bruker AutoPASS – på Flakk–Rørvik med en bompengeandel lagt inn i prisen.
Nord i fylket betjener én ferje både Geisnes og Lund fra Hofles, som er knutepunktet – det går ingen direkte tur mellom de to. Sidene viser avgangene for hver ukedag, fordi fredag og helg ofte avviker fra resten av uka.